Esse lance de não funcionar quando molha me faz lembrar do meu primeiro veículo a motor: uma Yamaha RD 125 1986, motor super mexido e transformada p/ 1993. Fazia média de 18 km/l, mas era um foguete.
Era chover e já era... velas, cabos, bobinas, acho que até os pneus não funcionavam na chuva
.Mas deixemos o passado de lado.
Nesse caso, já tive problema com a correia do alternador. Ao passar por uma poça d'água maior, ela patinava e o carro quase morria. Acho que seu problema é um pouco diferente.
Também acredito que seja ou o sensor de RPM (sensor hall, ou sensor da roda fônica), ou o distribuidor ou a bobina.